海神的女儿波妞从深海出逃玩耍，却被困在玻璃瓶里冲到岸上，碰巧被住在岸边悬崖的宗介救出，两人因此相识。但是波妞的父亲——魔法师藤本，认为人类世界肮脏丑陋，强行把波妞带回海里。面对父亲的阻挠、席卷小镇的海啸，以及永远失去魔法的威胁，波妞仍然大胆而坚决地决定——要变成人类跟宗介在一起。而承诺要永远保护波妞的宗介，也即将面临新的挑战...

比起美丽又飘渺如泡沫的人鱼公主，波妞更像是一只野性的小兽，带着惊涛骇浪向喜欢的人狂奔而去，波妞在浪上追逐着宗介全力奔跑的样子，无比动人又可爱！想起“我曾踏月而来，只因你在山中”，波妞是“我曾踏浪而来，只因你在崖边”。

和宫崎骏其他作品相较而言，波妞显然更具童趣，第一遍看的时候就被视觉效果深深吸引了，很喜欢手绘感十足的画风，仿佛进入了奇幻的童话世界，海之女神的出场美不胜收，水灾和海啸在这甜蜜的糖衣下也难以令人感到恐惧，就像是一个跌宕离奇的梦境，随上涨的潮水来到路面的鱼儿们在水光潋滟下摇曳生姿，仿佛安宁的“末世”，就连救援的船队也仿佛巡回祭典……据说由创纪录的17万张纯手工绘图制作而成，果然达到了精妙的效果，像是绘本万花筒。但在表现这些纯净的画面之时，也并没有避讳对于海底污浊垃圾的刻画，没有刻意凸显污浊，而是以强调纯净的方式使得那污浊的存在落在人们眼中更加刺目。

以及，波妞在水母上睡觉的时候想到了哆啦A梦海底鬼岩城的剧场版哈哈哈哈，大雄也说过想要和水母一起睡觉，想象一下那种在海底随浪摇曳的感觉，确实十分美妙。