故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..

魔法少女艾西亚借助魔法力量，使得初音岛上的樱花重新绽放。而初音岛樱花的再度开放，唤起众女对纯一的爱恋希望。在初音岛樱花神秘力量的引导下，小鸟、真子、宫环、爱丽丝、奈奈子等人皆用各自的方式，直接或间接地表达着对纯一的热恋，似乎每个人都在满足自己的幻想、享受自己的幸福。剧情俨然将向开端靠拢，故事好像也将从头开始。然而，真正的爱绝不会轻易被磨灭。纯一和音梦的爱恋源自点滴相处，所以他们彼此间拥有强烈的羁绊，并且最终如愿冲破魔法的阻碍，演绎有情人终成眷属的童话。艾西亚心地善良，希望所有人都能幸福，原本值得大加赞扬。但是，艾西亚不明白爱情的真谛，毕竟爱情具有排他性，永远无法大度的分享。