数年前，人类以超级战舰“轰天号”，在南极击溃“哥吉拉”，并且将“哥吉拉”封印在地底下。但是地球除了“哥吉拉”以外，还有许许多多的怪兽，对各大人类都市虎视眈眈。于是，人类成立了“地球防卫部”，专门对付各种怪兽的入侵。而地球防卫部最强大的成员，就是当年封印哥吉拉的“轰天号”以及其舰长“道格拉斯·戈登上校”。此外，为了应付怪兽对人类造成的困扰，地球防卫部特别甄选了有特殊能力的人类，这些“超人类”拥有普通人类所没有的“M染色体”，让这些人类拥有比普通人更强大的体能跟敏捷性，以应付怪兽的攻击，其中的佼佼者就是“尾崎真一少尉”。就在不久之前，人们挖到一个巨大怪物的遗骸，而且怪物拥有机械跟生物的本质，怀疑能够将生物跟机械结合起来的怪物应该来自于外太空。不久，尾崎真一收到来自婴儿岛“小美人”的警告，这个怪物是当年被“魔斯拉”给封印的“盖刚”，盖刚的出现代表着人类的危机。就在盖刚出土不久，世界各地突然在同一时间，遭受到了各大怪物的攻击，一时之间让地球防卫部忙的焦头烂额。但是突然出现的神秘飞行器，却将这些怪物全部都带走。这些自称“X星人”的外星来访客，声明自己是人类的朋友，要跟人类建立起同盟关系，更声称有一个巨大的星球即将撞上地球。但是在尾崎真一还有道格拉斯等人的调查之下，发现根本就没有神秘星球要撞击地球。而那些怪兽根本就是外星人侵略地球所释放的，X星人根本是要把人类当作粮食来利用。虽然外星人的真面目被揭穿，但是外星人拥有不可思议的超能力，还有手下听命于外星人的巨大怪物。地球防卫军最后被歼灭，只剩下轰天号还苟延残喘著。此时，道格拉斯想出一个大胆的计策，就是解开南极哥吉拉的封印，让代表地球最强大怪物的哥吉拉，去面对这些外星来的侵略者....

这部电影绝对可以用来考察观众对科幻片的了解程度。里边出现了众多科幻电影的经典场面和造型。
我看到的有：
1.巨大的怪兽，原型当然就是哥斯拉系列自己；
2.各大城市标志性建筑遭到破坏的镜头，《独立日》、《火星人玩转地球》等很多电影里都有，这一部中除了常见的自由女神、埃菲尔铁塔、悉尼歌剧院等名胜外，还照顾了一下中国的观众，加入了上海东方明珠和浦东被毁的场面；
3.用手挡住飞来的子弹，《黑客帝国》经典的一幕在本片重演；
4.挥舞长刀把子弹一一弹开，简直是Jedi武士归来；
5.胡子舰长把刀架在肩上的造型，他是不是刀锋战士的fans；
6.伪装成人类的外星人，有点像黑衣人的设定；
7.被反复用的一人单挑一群穿着相同人的场面。
似乎不只这些，大家继续补充吧