异能者们在国宝的瞬间移动的异能下逃离了狄少的追杀，但国宝还是来不及救莹莹，莹莹被邪恶组织狄少带走.郭少将由于与狄少长相一样，国宝把当他成狄少，导致郭少将被众人怀疑，后来郭少将努力澄清了事实，团队又重新聚集到了一起，然后他们之前狄少留下的线索找到了下落不明的莹莹。接着，他们接到一个来自汤博士儿子的电话，电话里面揭露出了一个惊天秘密：国家正在培养异能者战斗人。郭少将带领着团队向这个不知是真是假的地方探索虚实，不料中途遇袭，郭少将的上司魏建警官带着汤靖文出现制止了打斗，并决定让他们参加异能培训，对抗邪恶组织。魏建接到了上级通知，需要异能者去营救一个人质，最终将人质安全解救带回基地。《异能者2》就如中国版本的《X战警》，团队中拥有不同的异能者，相互合作，同心协力共同对抗着邪恶组织，虽然没有《X战警》宏伟的战争场面，以及绚丽的特技特效，但是却用最真实的表现手法表达了人们最深沉的价值观，如果真的拥有超能力，人们是会仍保持初心，用超能力做好事，还是会被能力带来的好处所诱惑而违背自己的良心干坏事，就如《X战警》中博士所说的：“权力腐化人心”。这一切的选择不过是在人们的一念之间.......